Pomysł uruchomienia pociągu papieskiego zrodził się podczas III ogólnopolskiej pielgrzymki polskich kolejarzy do Sanktuarium Miłosierdzia Bożego w Krakowskich Łagiewnikach w dniu 3 września 2005 roku. Jego autorem jest kolejarz z wykształcenia, kapłan z powołania, duszpasterz kolejarzy archidiecezji warszawskiej i animator Katolickiego Stowarzyszenia Kolejarzy Polskich - ks. Ryszard Marciniak SAC

W pierwszej wersji, tradycyjny pociąg pomalowany w barwy papieskie, miał spełniać przede wszystkim funkcję komunikacyjną i służyć usprawnieniu połączenia kolejowego Wadowic z Krakowem. Chcieliśmy aby z Wadowic, z miejsca narodzin i młodości Papieża, każdy pielgrzym i turysta mógł bez problemów poprzez Kalwarię Zebrzydowską z jej Sanktuarium Pasyjno-Maryjnym, dotrzeć do Krakowa, skąd Opatrzność Boża powołała ks. kard. Karola Wojtyłę na stolicę św. Piotra w Rzymie. Ostatecznie, papieski pociąg "Totus Tuus" uzyskał nie tylko nowoczesną sylwetkę i ciepłą kolorystykę ale stał się pojazdem na pokładzie którego, każdy z podróżnych może spotkać Sługę Bożego Jana Pawła II w Jego nauczaniu i działalności.

Stoimy ciągle wobec aktualnego zaproszenia Jana Pawła II do wypełnienia misji wielkiej wiosny chrześcijaństwa, nowej ewangelizacji, budowania cywilizacji miłości. To zadanie zostało powierzone nie tylko bezpośrednim świadkom Jego pontyfikatu ale i tym co nie mieli możliwości osobistego z Nim spotkania. Multimedialne studio, stanowiące serce pociągu, pozwala poprzez sieć głośników i kolorowych monitorów przekazać wszystkim uczestnikom przejazdu zarówno informacje o wybranych wydarzeniach z pontyfikatu Jana Pawła II jak zapoznać z najważniejszymi tematami papieskiego nauczania. Nośnikami informacji są filmy, prezentacje audiowizualne a często także żywy głos.

Jesteśmy dumni z tego, że projekt pociągu papieskiego wykonał zespół młodych inzynierów z krakowskiej firmy EC Engineering należącej do grupy ENERGOCONTROL, natomiast jego zbudowaniem, w rekordowo krótkim czasie czterech miesięcy, może się pochwalić nowosądecki NEWAG (dawne ZNTK Nowy Sącz).

Ten wyjątkowy, jedyny na świecie pojazd, został w dniu 27 maja 2006 roku, pobłogosławiony w Krakowie Łagiewnikach przez Ojca Świętego Benedykta XVI jako kolejarskie wotum za pontyfikat Ojca Świętego Jana Pawła II. 2 czerwca 2006 roku, a więc 9 miesięcy od zaprezentowania pomysłu, przy obecności Jego Eminencji ks. kard. Stanisława Dziwisza na pokładzie, rozpoczął służbę na kolejowych szlakach Polski i Europy. Od tego dnia Jan Paweł II zaprosił na pokład pociągu papieskiego wielu biskupów z Polski i z zagranicy, w tym także z Watykanu. W tej wyjątkowej i niepowtarzalnej audiencji z Papieżem Polakiem uczestniczyło już ponad 150 tys. zarówno pojedynczych osób jak i zorganizowanych grup pielgrzymów i turystów z różnych stron Polski, Europy a także z pozostałych kontynentów. Dzięki współczesnej technice, Jan Pawel II realizuje swoją misję głównie na kolejowym szlaku Jana Pawła II z Wadowic do Krakowa. W czasie przejazdu przygotowuje podróżujących papieskim pociągiem do bardziej racjonalnego, bardziej owocnego spotkania z Nim w tych miejscach, które kształtowały Jego wielkie serce.

Ale tak jak nie ograniczał swoich pielgrzymek do Rzymu i okolic tak dzięki fantazji i zapałowi wielu prawdziwych Jego miłośników odbywa swe duszpasterskie wizyty i poza teren Małopolski. Był już w Warszawie, Białymstoku, Opolu, Wrocławiu a nawet w Zilinie, Koszycach czy Zwoleniu na Słowacji. Czy dotrze w 2009 roku do Gdańska, Torunia, Siedlec, Gliwic, Sandomierza lub Starego Sacza.? Sposobnymi okazjami do takich pielgrzymek wydają się być przypadające rocznice pielgrzymek papieskich z 1979 i 1999 roku.